学内LAN環境においての、githubからのcloneのやり方です。
proxyを越えます。
まず、--globalで.gitconfigに設定を追加する
$ git config --global http.proxy {proxy url}:{port}
あとは普通にhttpsでcloneしてあげると、上で設定したconfigが読み込まれる
$ git clone https://github.com/{githubアカウント名}/{リポジトリ名}.git
.gitconfigと.git/configの違いですね。
前者は全てに影響して、後者はそのリポジトリのみに影響するようですね。